La division Fringe enquête sur des explosions qui ne laissent aucune trâce d'un quelconque explosif sur les lieux, et encore moins d'un détonateur. Celà conduira l'agent Dunham et Peter en Iraq à en apprendre plus sur le projet Tin Man - projet militaire expérimental confidentiel - développé lors de la guerre en Iraq pour neutraliser une neurotoxine synthétique. Le projet, bien que supposément arrêté, fut visiblement continué par un colonel devenu un élément incontrôlable. En parallèle, Peter, qui veut sa chambre bien à lui, cherche un nouvel appartement pour lui et Walter. Mais avec Walter... rien n'est jamais simple.